Технологии искусственного интеллекта по анализу мультимодальных больших данных для диагностики и прогнозирования рака молочной железы

Задачи (WP- work packages)

Ожидаемые результаты

WP1: Разработка и обучение моделей.

Обучение моделей глубоких нейронных сетей на данных из открытых источников.

Будут обучены модели глубоких нейронных сетей.

Подготовка и подача статьей по глубоким нейронным сетям.

Будут опубликованы не менее двух статей и (или) обзоров в рецензируемых научных изданиях по научному направлению программы, входящих в 1 (первый), 2 (второй) квартиль по импакт-фактору в базе данных Web of Science и (или) имеющих процентиль по CiteScore в базе данных Scopus не менее 50 (пятидесяти) или в журналах, рекомендованных КОКНВО.

Разработка предварительно обученных и частично обученных Vision-Language моделей.

Будут разработаны и обучены Vision-Language модели

WP2: Сбор данных

Анкетирование и сбор данных.

Будут проведены до конца 2025 года:

•          Анкетирование 446 верифицированных больных для проспективных исследований;

•          Предоставление маммографических снимков по 446 верифицированным больным;

•          Предоставление данных по ультразвуковым исследованиям по 446 верифицированным больным;

•          Предоставление данных по магнитно-резонансной томографии по 446 верифицированным больным;

•          Оцифровка гистологических стекол по 446 верифицированным больным;

•          Предоставление оцифрованных данных по гистологическим стеклам по 446 верифицированным больным;

•          Оцифровка гистологических стекол по 2000 верифицированным больным для ретроспективных исследований;

•          Предоставление оцифрованных данных по гистологическим стеклам по 2000 верифицированным больным для ретроспективных исследований;

•          Предоставление табличных, текстовых и биомаркерных данных по 446 верифицированным больным;

•          Предоставление гистологических стекол для геномных исследований по 446 верифицированным больным.

Будут проведены до конца 2026 года:

•          Анкетирование 554 верифицированных больных для проспективных исследований;

•          Предоставление маммографических снимков по 554 верифицированным больным;

•          Предоставление данных по ультразвуковым исследованиям по 554 верифицированным больным;

•          Предоставление данных по магнитно-резонансной томографии по 554 верифицированным больным;

•          Оцифровка гистологических стекол по 554 верифицированным больным;

•          Предоставление оцифрованных данных по гистологическим стеклам по 554 верифицированным больным;

•          Предоставление табличных, текстовых и биомаркерных данных по 554 верифицированным больным;

•          Предоставление гистологических стекол для геномных исследований по 554 верифицированным больным.

Обработка и маркировка данных.

Будет проведена анонимизация, обработка и маркировка данных для ретроспективных исследований (маммография – 5000, ультразвуковое исследование – 2000, магнитно-резонансная томография – 2000, гистология – 2000) до конца 2025 года. 

Будут проведены до конца 2026 года:

•          Анонимизация, обработка и маркировка данных для ретроспективных исследований (компьютерная томография – 2000, табличные данные – 5000, текстовые данные – 2000, биомаркеры – 2000);

•          Анонимизация, обработка и маркировка данных для проспективных исследований (маммография – 1000, ультразвуковое исследование – 1000, магнитно-резонансная томография – 1000, гистология – 1000, табличные данные – 1000, текстовые данные – 1000, биомаркеры – 1000).  

 Изучение и выявление генетико-молекулярных маркеров рака молочной железы.

Будут проведены до конца 2025 года:

•          Транспортировка биоматериалов (кровь и ткань) 235 пациентов;

•          Секвенирование биоматериалов 235 пациентов

•          Закупка реагентов для приготовления и обогащения библиотек, проведения контроля качества ДНК, проведения секвенирования  для 235 пациентов

•          Закупка расходных материалов, необходимых для проведения исследования для 235 пациентов

•          Биоинформатический анализ данных секвенирования 235 пациентов•           Подготовка научной статьи;

•          Подготовка НПА.

Будут проведены до конца 2026 года:

•          Транспортировка биоматериалов (кровь и ткань) 265 пациентов;

•          Секвенирование биоматериалов 265 пациентов.

•          Закупка реагентов для приготовления и обогащения библиотек, проведения контроля качества ДНК, проведения секвенирования  для 265 пациентов

•          Закупка расходных материалов, необходимых для проведения исследования для 265 пациентов

•          Биоинформатический анализ данных секвенирования 265 пациентов

WP3: Нормативные документы

Проведения исследований по нормативным документам для сбора и хранения больших мультимодальных данных.

Будут проведены:

•          Изучение и анализ НПА;

•          Проведение литературного обзора;

•          Подготовка научной статьи;

•          Подготовка НПА.

Проведения исследований по нормативным документам для тестирования результатов технологий искусственного интеллекта.

Будут проведены:

•          Изучение и анализ НПА;

•          Подготовка НПА.

Проведения исследований по нормативным документам для применения результатов технологий искусственного интеллекта при принятии решений медицинскими работниками.

Будут проведены:

•          Изучение и анализ НПА;

•          Проведение литературного обзора;

•          Подготовка научной статьи;

•          Подготовка НПА.