Вильнюс университеті — Литвадағы алғашқы және ең ірі университет, сонымен қатар Орталық және Шығыс Еуропадағы ең көне және ең танымал жоғары оқу орындарының бірі болып табылатын мемлекеттік зерттеу университеті. Бүгінде бұл Литваның жетекші ғылыми-зерттеу мекемесі.
Университетті 1579 жылы Стефан Баторий Вильнюс иезуит академиясы (колледжі) ретінде құрды. Бұл поляк-литва Достастығындағы үшінші көне университет (Краков академиясы мен Альбертинадан кейін) болды. Қараша көтерілісінің сәтсіздігіне байланысты (1830-1831) университет жабылып, 1919 жылға дейін жұмысын тоқтатты. Бірінші дүниежүзілік соғыстан кейін университет оны жергілікті поляктар, литвалықтар және басқыншы Кеңес әскерлері қалпына келтірудің сәтсіз әрекеттерінен аман қалды. Ол 1919 жылы тамызда Стефан Батория поляк университеті ретінде жұмысын жалғастырды.
1939 жылы қыркүйекте Польшаға кеңес шапқыншылығынан кейін университетті Литва билігі біраз уақыт басқарды (1939 жылдың қазанынан бастап), содан кейін 1941 жылдан 1944 жылға дейін Барбаросса операциясынан кейін неміс оккупациясы кезеңімен үзілген Литваның кеңестік аннексиясынан кейін (1940 ж.маусым) Вильнюс мемлекеттік университеті. 1945 жылы Стефан Батория университетінің поляк студенттер мен ғалымдар қауымдастығы Торунидегі Николай Коперник университетіне ауыстырылды. 1990 жылы Литва тәуелсіздігін қалпына келтіргеннен кейін, Кеңес Одағы ыдырағаннан кейін, ол Литвадағы жетекші университеттердің бірі мәртебесін қалпына келтірді.
Ол 1579 жылы Литва астанасы Вильнюсте құрылды, факультеті екінші үлкен Каунас қаласында және тағы біреуі төртінші үлкен Шяуляй қаласында орналасқан. Университет 24000-нан астам студенттерге арналған академиялық пәндердің кең спектрі бойынша 200-ден астам оқу бағдарламаларын ұсынатын он бес факультеттен тұрады. Вильнюс университеті мәдени орталық, денсаулық және спорт орталығы, кітапхана, мұражай, Ботаникалық бақ және басқа да мекемелер сияқты университеттің академиялық емес бөлімшелері ұсынатын қосымша іс-шараларға қатысуымен, өзара әрекеттесуімен және қатысуымен танымал.
2016 жылдан бастап Вильнюс университеті беделді университеттер желісінің мүшесі — Coimbra Group-және 2019 жылдан бастап Еуропалық университеттер Альянсының (ARQUS) құрамына кіреді. Альянс зерттеу, ғылым және әлеуметтік серіктестік саласындағы тығыз ведомствоаралық ынтымақтастық үшін бірлескен, ұзақ мерзімді, тұрақты құрылымдар мен механизмдерді құруға бағытталған. Вильнюс университетінің қоры 2016 жылдың 6 сәуірінде Литвадағы алғашқы университет қоры ретінде құрылды. Қор жоғары сапалы ғылыми зерттеулерді және әлемдік талаптарға сәйкес келетін оқу бағдарламаларын құруды қолдайды, сонымен бірге басқа да жоғары құнды жобаларды ынталандырады.